Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA3P51805 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA3P51805 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA3P51805 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA3P51805 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA3P51805 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA3P51805 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA3P51805 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA3P51805 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA3P51805 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA3P51805 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA3P51805 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA3P51805 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA3P51805 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA3P51805 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA3P51805 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA3P51805 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA3P51805 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA3P51805 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA3P51805 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA3P51805 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA3P51805 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA3P51805 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA3P51805 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA3P51805 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA3P51805 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA3P51805 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA3P51805 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms