Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCR4P51679 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCR4P51679 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCR4P51679 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCR4P51679 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCR4P51679 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCR4P51679 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCR4P51679 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCR4P51679 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCR4P51679 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCR4P51679 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCR4P51679 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCR4P51679 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCR4P51679 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCR4P51679 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCR4P51679 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCR4P51679 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCR4P51679 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCR4P51679 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCR4P51679 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCR4P51679 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCR4P51679 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCR4P51679 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCR4P51679 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCR4P51679 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCR4P51679 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCR4P51679 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCR4P51679 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCR4P51679 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCR4P51679 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCR4P51679 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCR4P51679 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCR4P51679 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCR4P51679 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCR4P51679 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCR4P51679 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCR4P51679 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCR4P51679 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCR4P51679 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCR4P51679 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCR4P51679 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCR4P51679 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCR4P51679 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCR4P51679 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCR4P51679 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCR4P51679 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCR4P51679 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCR4P51679 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCR4P51679 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCR4P51679 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCR4P51679 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCR4P51679 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCR4P51679 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCR4P51679 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCR4P51679 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCR4P51679 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCR4P51679 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCR4P51679 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCR4P51679 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCR4P51679 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCR4P51679 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCR4P51679 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCR4P51679 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCR4P51679 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCR4P51679 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCR4P51679 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCR4P51679 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCR4P51679 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCR4P51679 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCR4P51679 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCR4P51679 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCR4P51679 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCR4P51679 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCR4P51679 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCR4P51679 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCR4P51679 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCR4P51679 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCR4P51679 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCR4P51679 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCR4P51679 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCR4P51679 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCR4P51679 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCR4P51679 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms