Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms