Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC3P51654 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC3P51654 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC3P51654 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC3P51654 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC3P51654 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC3P51654 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC3P51654 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC3P51654 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC3P51654 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC3P51654 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC3P51654 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC3P51654 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC3P51654 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC3P51654 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC3P51654 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC3P51654 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC3P51654 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC3P51654 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPC3P51654 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPC3P51654 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPC3P51654 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPC3P51654 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPC3P51654 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC3P51654 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC3P51654 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC3P51654 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC3P51654 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC3P51654 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC3P51654 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC3P51654 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC3P51654 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC3P51654 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC3P51654 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC3P51654 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC3P51654 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC3P51654 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC3P51654 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC3P51654 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC3P51654 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC3P51654 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC3P51654 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC3P51654 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC3P51654 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC3P51654 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC3P51654 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC3P51654 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC3P51654 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC3P51654 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC3P51654 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC3P51654 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC3P51654 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC3P51654 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC3P51654 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC3P51654 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC3P51654 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC3P51654 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC3P51654 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC3P51654 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC3P51654 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC3P51654 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC3P51654 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC3P51654 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC3P51654 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC3P51654 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC3P51654 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC3P51654 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC3P51654 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC3P51654 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC3P51654 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC3P51654 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC3P51654 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC3P51654 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC3P51654 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC3P51654 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC3P51654 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC3P51654 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC3P51654 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC3P51654 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC3P51654 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms