Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC40.19■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC40.17■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA2P51531 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
SMARCA2P51531 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms