Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RORCP51449 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RORCP51449 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RORCP51449 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RORCP51449 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RORCP51449 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RORCP51449 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RORCP51449 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RORCP51449 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RORCP51449 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RORCP51449 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RORCP51449 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RORCP51449 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RORCP51449 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RORCP51449 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RORCP51449 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RORCP51449 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RORCP51449 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RORCP51449 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RORCP51449 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RORCP51449 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RORCP51449 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RORCP51449 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RORCP51449 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RORCP51449 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RORCP51449 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RORCP51449 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RORCP51449 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RORCP51449 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RORCP51449 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RORCP51449 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RORCP51449 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RORCP51449 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RORCP51449 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RORCP51449 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RORCP51449 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RORCP51449 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RORCP51449 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RORCP51449 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RORCP51449 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RORCP51449 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RORCP51449 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RORCP51449 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RORCP51449 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RORCP51449 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RORCP51449 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RORCP51449 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RORCP51449 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RORCP51449 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RORCP51449 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RORCP51449 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RORCP51449 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RORCP51449 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RORCP51449 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RORCP51449 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RORCP51449 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RORCP51449 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RORCP51449 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RORCP51449 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RORCP51449 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RORCP51449 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RORCP51449 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RORCP51449 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RORCP51449 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RORCP51449 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RORCP51449 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RORCP51449 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RORCP51449 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RORCP51449 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RORCP51449 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RORCP51449 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RORCP51449 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RORCP51449 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RORCP51449 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RORCP51449 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RORCP51449 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RORCP51449 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RORCP51449 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RORCP51449 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RORCP51449 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RORCP51449 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RORCP51449 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RORCP51449 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RORCP51449 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RORCP51449 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RORCP51449 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RORCP51449 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RORCP51449 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RORCP51449 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RORCP51449 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RORCP51449 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RORCP51449 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RORCP51449 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RORCP51449 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RORCP51449 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RORCP51449 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RORCP51449 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RORCP51449 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RORCP51449 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RORCP51449 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms