Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCAMP50895 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCAMP50895 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BCAMP50895 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCAMP50895 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCAMP50895 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCAMP50895 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BCAMP50895 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCAMP50895 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCAMP50895 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCAMP50895 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCAMP50895 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BCAMP50895 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BCAMP50895 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCAMP50895 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCAMP50895 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCAMP50895 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCAMP50895 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCAMP50895 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCAMP50895 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCAMP50895 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAMP50895 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAMP50895 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAMP50895 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAMP50895 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAMP50895 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAMP50895 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAMP50895 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAMP50895 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAMP50895 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAMP50895 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAMP50895 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAMP50895 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAMP50895 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAMP50895 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCAMP50895 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCAMP50895 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCAMP50895 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCAMP50895 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCAMP50895 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCAMP50895 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCAMP50895 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCAMP50895 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCAMP50895 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAMP50895 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAMP50895 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAMP50895 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAMP50895 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAMP50895 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAMP50895 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAMP50895 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAMP50895 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAMP50895 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAMP50895 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAMP50895 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAMP50895 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCAMP50895 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCAMP50895 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCAMP50895 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCAMP50895 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCAMP50895 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCAMP50895 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCAMP50895 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCAMP50895 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCAMP50895 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCAMP50895 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCAMP50895 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCAMP50895 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCAMP50895 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BCAMP50895 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCAMP50895 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
BCAMP50895 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCAMP50895 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCAMP50895 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCAMP50895 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCAMP50895 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BCAMP50895 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCAMP50895 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCAMP50895 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCAMP50895 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCAMP50895 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCAMP50895 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BCAMP50895 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BCAMP50895 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCAMP50895 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCAMP50895 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAMP50895 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAMP50895 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAMP50895 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAMP50895 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAMP50895 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAMP50895 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAMP50895 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAMP50895 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAMP50895 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAMP50895 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAMP50895 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAMP50895 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAMP50895 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAMP50895 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms