Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF6P49848 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF6P49848 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF6P49848 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF6P49848 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF6P49848 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF6P49848 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF6P49848 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF6P49848 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF6P49848 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF6P49848 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF6P49848 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF6P49848 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF6P49848 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF6P49848 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF6P49848 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF6P49848 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF6P49848 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF6P49848 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF6P49848 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF6P49848 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF6P49848 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF6P49848 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF6P49848 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF6P49848 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF6P49848 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF6P49848 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF6P49848 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF6P49848 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF6P49848 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF6P49848 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF6P49848 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF6P49848 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF6P49848 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF6P49848 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF6P49848 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF6P49848 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF6P49848 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF6P49848 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF6P49848 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF6P49848 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF6P49848 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF6P49848 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF6P49848 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF6P49848 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF6P49848 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF6P49848 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF6P49848 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF6P49848 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF6P49848 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF6P49848 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF6P49848 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF6P49848 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF6P49848 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF6P49848 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF6P49848 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF6P49848 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF6P49848 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF6P49848 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF6P49848 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF6P49848 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF6P49848 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF6P49848 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF6P49848 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF6P49848 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF6P49848 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF6P49848 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF6P49848 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF6P49848 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF6P49848 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF6P49848 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF6P49848 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF6P49848 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF6P49848 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF6P49848 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF6P49848 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF6P49848 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF6P49848 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF6P49848 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF6P49848 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms