Protein–RNA interactions for Protein: P49746

THBS3, Thrombospondin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3P49746 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS3P49746 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS3P49746 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS3P49746 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS3P49746 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS3P49746 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS3P49746 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS3P49746 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS3P49746 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS3P49746 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS3P49746 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS3P49746 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS3P49746 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS3P49746 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS3P49746 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS3P49746 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS3P49746 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS3P49746 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS3P49746 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS3P49746 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS3P49746 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS3P49746 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS3P49746 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS3P49746 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS3P49746 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS3P49746 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS3P49746 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS3P49746 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS3P49746 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS3P49746 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
THBS3P49746 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
THBS3P49746 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
THBS3P49746 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS3P49746 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS3P49746 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS3P49746 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS3P49746 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS3P49746 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS3P49746 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS3P49746 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS3P49746 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS3P49746 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS3P49746 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS3P49746 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS3P49746 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS3P49746 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS3P49746 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS3P49746 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS3P49746 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS3P49746 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS3P49746 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS3P49746 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS3P49746 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS3P49746 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS3P49746 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS3P49746 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS3P49746 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS3P49746 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS3P49746 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS3P49746 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS3P49746 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS3P49746 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS3P49746 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS3P49746 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS3P49746 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS3P49746 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS3P49746 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS3P49746 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS3P49746 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS3P49746 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS3P49746 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS3P49746 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS3P49746 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS3P49746 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS3P49746 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS3P49746 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS3P49746 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS3P49746 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms