Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNC1P48547 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.7 ms