Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARCN1P48444 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms