Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms