Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF4P48230 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms