Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA8P48165 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA8P48165 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA8P48165 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA8P48165 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA8P48165 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA8P48165 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA8P48165 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA8P48165 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA8P48165 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA8P48165 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA8P48165 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA8P48165 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA8P48165 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA8P48165 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA8P48165 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA8P48165 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA8P48165 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA8P48165 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA8P48165 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA8P48165 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA8P48165 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA8P48165 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA8P48165 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA8P48165 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA8P48165 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA8P48165 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA8P48165 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA8P48165 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA8P48165 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA8P48165 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA8P48165 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA8P48165 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA8P48165 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA8P48165 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA8P48165 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA8P48165 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA8P48165 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA8P48165 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA8P48165 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA8P48165 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA8P48165 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA8P48165 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA8P48165 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA8P48165 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA8P48165 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA8P48165 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA8P48165 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA8P48165 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA8P48165 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA8P48165 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA8P48165 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA8P48165 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA8P48165 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA8P48165 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA8P48165 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA8P48165 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA8P48165 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA8P48165 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA8P48165 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA8P48165 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA8P48165 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA8P48165 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA8P48165 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA8P48165 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA8P48165 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA8P48165 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA8P48165 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA8P48165 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA8P48165 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA8P48165 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA8P48165 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA8P48165 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA8P48165 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA8P48165 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA8P48165 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA8P48165 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA8P48165 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA8P48165 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA8P48165 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA8P48165 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA8P48165 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA8P48165 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA8P48165 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA8P48165 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA8P48165 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA8P48165 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA8P48165 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA8P48165 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA8P48165 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA8P48165 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA8P48165 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA8P48165 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA8P48165 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA8P48165 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA8P48165 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA8P48165 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA8P48165 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA8P48165 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA8P48165 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms