Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UTRNP46939 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UTRNP46939 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UTRNP46939 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UTRNP46939 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UTRNP46939 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UTRNP46939 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UTRNP46939 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UTRNP46939 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
UTRNP46939 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
UTRNP46939 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UTRNP46939 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
UTRNP46939 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UTRNP46939 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UTRNP46939 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UTRNP46939 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UTRNP46939 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UTRNP46939 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UTRNP46939 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UTRNP46939 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UTRNP46939 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
UTRNP46939 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UTRNP46939 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UTRNP46939 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UTRNP46939 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UTRNP46939 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UTRNP46939 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UTRNP46939 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UTRNP46939 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UTRNP46939 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UTRNP46939 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UTRNP46939 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
UTRNP46939 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UTRNP46939 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UTRNP46939 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UTRNP46939 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UTRNP46939 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UTRNP46939 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UTRNP46939 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UTRNP46939 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UTRNP46939 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UTRNP46939 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UTRNP46939 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UTRNP46939 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UTRNP46939 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UTRNP46939 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UTRNP46939 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UTRNP46939 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UTRNP46939 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UTRNP46939 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UTRNP46939 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UTRNP46939 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UTRNP46939 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UTRNP46939 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UTRNP46939 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UTRNP46939 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
UTRNP46939 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
UTRNP46939 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UTRNP46939 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UTRNP46939 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UTRNP46939 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UTRNP46939 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UTRNP46939 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UTRNP46939 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UTRNP46939 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UTRNP46939 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UTRNP46939 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UTRNP46939 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
UTRNP46939 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UTRNP46939 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UTRNP46939 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UTRNP46939 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UTRNP46939 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UTRNP46939 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
UTRNP46939 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UTRNP46939 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UTRNP46939 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UTRNP46939 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UTRNP46939 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
UTRNP46939 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UTRNP46939 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UTRNP46939 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UTRNP46939 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UTRNP46939 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UTRNP46939 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UTRNP46939 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UTRNP46939 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UTRNP46939 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UTRNP46939 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UTRNP46939 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UTRNP46939 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UTRNP46939 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UTRNP46939 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UTRNP46939 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UTRNP46939 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UTRNP46939 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UTRNP46939 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UTRNP46939 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UTRNP46939 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UTRNP46939 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms