Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN1BP46527 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms