Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP5P45974 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP5P45974 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP5P45974 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP5P45974 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP5P45974 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP5P45974 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP5P45974 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP5P45974 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP5P45974 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP5P45974 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP5P45974 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP5P45974 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP5P45974 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP5P45974 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP5P45974 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP5P45974 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP5P45974 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP5P45974 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP5P45974 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP5P45974 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP5P45974 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP5P45974 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP5P45974 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP5P45974 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP5P45974 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP5P45974 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
USP5P45974 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP5P45974 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP5P45974 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP5P45974 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP5P45974 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP5P45974 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
USP5P45974 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP5P45974 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP5P45974 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP5P45974 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP5P45974 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP5P45974 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP5P45974 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP5P45974 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP5P45974 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP5P45974 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP5P45974 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP5P45974 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP5P45974 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP5P45974 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP5P45974 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP5P45974 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP5P45974 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP5P45974 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP5P45974 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP5P45974 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP5P45974 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP5P45974 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP5P45974 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP5P45974 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP5P45974 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP5P45974 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP5P45974 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP5P45974 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP5P45974 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP5P45974 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP5P45974 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP5P45974 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP5P45974 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP5P45974 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP5P45974 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP5P45974 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP5P45974 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP5P45974 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP5P45974 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP5P45974 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP5P45974 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP5P45974 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP5P45974 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP5P45974 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP5P45974 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP5P45974 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP5P45974 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP5P45974 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP5P45974 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP5P45974 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP5P45974 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP5P45974 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP5P45974 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP5P45974 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP5P45974 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP5P45974 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP5P45974 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP5P45974 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP5P45974 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP5P45974 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP5P45974 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP5P45974 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP5P45974 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP5P45974 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP5P45974 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP5P45974 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP5P45974 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms