Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEA3P43357 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms