Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF5P43026 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF5P43026 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF5P43026 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF5P43026 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF5P43026 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF5P43026 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF5P43026 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF5P43026 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF5P43026 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF5P43026 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF5P43026 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF5P43026 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF5P43026 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF5P43026 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF5P43026 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF5P43026 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF5P43026 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF5P43026 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF5P43026 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF5P43026 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF5P43026 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF5P43026 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF5P43026 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF5P43026 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF5P43026 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF5P43026 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF5P43026 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF5P43026 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF5P43026 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF5P43026 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF5P43026 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF5P43026 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF5P43026 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF5P43026 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF5P43026 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF5P43026 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF5P43026 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF5P43026 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF5P43026 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF5P43026 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF5P43026 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF5P43026 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF5P43026 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF5P43026 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF5P43026 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF5P43026 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF5P43026 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF5P43026 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF5P43026 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF5P43026 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF5P43026 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF5P43026 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF5P43026 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF5P43026 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF5P43026 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF5P43026 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF5P43026 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF5P43026 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF5P43026 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF5P43026 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GDF5P43026 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDF5P43026 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDF5P43026 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDF5P43026 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF5P43026 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF5P43026 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF5P43026 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF5P43026 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF5P43026 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF5P43026 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF5P43026 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF5P43026 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF5P43026 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF5P43026 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF5P43026 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF5P43026 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms