Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL35P42766 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL35P42766 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL35P42766 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL35P42766 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL35P42766 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL35P42766 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL35P42766 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL35P42766 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL35P42766 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL35P42766 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL35P42766 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL35P42766 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL35P42766 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL35P42766 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL35P42766 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL35P42766 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL35P42766 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL35P42766 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL35P42766 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL35P42766 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL35P42766 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL35P42766 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL35P42766 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL35P42766 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL35P42766 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL35P42766 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL35P42766 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL35P42766 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL35P42766 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL35P42766 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL35P42766 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL35P42766 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL35P42766 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL35P42766 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL35P42766 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL35P42766 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL35P42766 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL35P42766 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL35P42766 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL35P42766 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL35P42766 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL35P42766 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL35P42766 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL35P42766 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL35P42766 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL35P42766 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL35P42766 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL35P42766 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL35P42766 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL35P42766 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL35P42766 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL35P42766 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL35P42766 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL35P42766 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL35P42766 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL35P42766 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL35P42766 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL35P42766 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL35P42766 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL35P42766 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL35P42766 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL35P42766 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL35P42766 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL35P42766 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL35P42766 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL35P42766 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL35P42766 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL35P42766 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL35P42766 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL35P42766 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL35P42766 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL35P42766 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL35P42766 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL35P42766 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL35P42766 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL35P42766 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL35P42766 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL35P42766 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL35P42766 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL35P42766 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL35P42766 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms