Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMPOP42166 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMPOP42166 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMPOP42166 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMPOP42166 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMPOP42166 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMPOP42166 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMPOP42166 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMPOP42166 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMPOP42166 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TMPOP42166 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMPOP42166 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMPOP42166 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMPOP42166 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMPOP42166 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMPOP42166 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TMPOP42166 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMPOP42166 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMPOP42166 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMPOP42166 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMPOP42166 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMPOP42166 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMPOP42166 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMPOP42166 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMPOP42166 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMPOP42166 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMPOP42166 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMPOP42166 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMPOP42166 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMPOP42166 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMPOP42166 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMPOP42166 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMPOP42166 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMPOP42166 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMPOP42166 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMPOP42166 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMPOP42166 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMPOP42166 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMPOP42166 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMPOP42166 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMPOP42166 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMPOP42166 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMPOP42166 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMPOP42166 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMPOP42166 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TMPOP42166 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TMPOP42166 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMPOP42166 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMPOP42166 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMPOP42166 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMPOP42166 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMPOP42166 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TMPOP42166 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMPOP42166 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMPOP42166 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMPOP42166 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TMPOP42166 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMPOP42166 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMPOP42166 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMPOP42166 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMPOP42166 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMPOP42166 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMPOP42166 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMPOP42166 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMPOP42166 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMPOP42166 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMPOP42166 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMPOP42166 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMPOP42166 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMPOP42166 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMPOP42166 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TMPOP42166 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMPOP42166 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMPOP42166 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMPOP42166 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMPOP42166 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMPOP42166 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMPOP42166 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMPOP42166 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMPOP42166 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMPOP42166 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMPOP42166 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMPOP42166 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TMPOP42166 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMPOP42166 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMPOP42166 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TMPOP42166 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TMPOP42166 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMPOP42166 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMPOP42166 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMPOP42166 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMPOP42166 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMPOP42166 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TMPOP42166 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMPOP42166 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMPOP42166 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMPOP42166 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMPOP42166 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TMPOP42166 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMPOP42166 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms