Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKCIP41743 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCIP41743 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms