Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX2P40425 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX2P40425 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX2P40425 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX2P40425 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX2P40425 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX2P40425 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX2P40425 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX2P40425 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX2P40425 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX2P40425 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX2P40425 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX2P40425 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX2P40425 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX2P40425 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX2P40425 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX2P40425 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX2P40425 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX2P40425 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX2P40425 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX2P40425 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX2P40425 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PBX2P40425 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBX2P40425 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PBX2P40425 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PBX2P40425 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBX2P40425 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBX2P40425 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBX2P40425 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PBX2P40425 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PBX2P40425 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX2P40425 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX2P40425 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX2P40425 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX2P40425 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX2P40425 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX2P40425 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX2P40425 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX2P40425 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX2P40425 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX2P40425 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX2P40425 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX2P40425 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PBX2P40425 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PBX2P40425 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PBX2P40425 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PBX2P40425 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PBX2P40425 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PBX2P40425 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PBX2P40425 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX2P40425 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX2P40425 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX2P40425 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX2P40425 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX2P40425 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX2P40425 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX2P40425 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX2P40425 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX2P40425 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX2P40425 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX2P40425 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX2P40425 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PBX2P40425 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PBX2P40425 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PBX2P40425 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PBX2P40425 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PBX2P40425 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PBX2P40425 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PBX2P40425 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PBX2P40425 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PBX2P40425 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PBX2P40425 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PBX2P40425 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX2P40425 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX2P40425 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX2P40425 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX2P40425 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX2P40425 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX2P40425 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX2P40425 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX2P40425 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms