Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFI27P40305 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFI27P40305 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFI27P40305 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFI27P40305 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFI27P40305 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFI27P40305 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFI27P40305 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFI27P40305 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFI27P40305 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFI27P40305 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFI27P40305 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFI27P40305 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFI27P40305 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFI27P40305 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFI27P40305 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFI27P40305 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFI27P40305 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFI27P40305 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFI27P40305 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFI27P40305 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFI27P40305 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFI27P40305 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFI27P40305 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFI27P40305 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFI27P40305 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFI27P40305 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFI27P40305 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFI27P40305 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFI27P40305 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IFI27P40305 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IFI27P40305 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFI27P40305 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFI27P40305 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFI27P40305 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFI27P40305 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFI27P40305 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFI27P40305 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFI27P40305 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms