Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEACAM3P40198 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms