Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP12P39900 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP12P39900 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MMP12P39900 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP12P39900 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP12P39900 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP12P39900 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP12P39900 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP12P39900 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP12P39900 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP12P39900 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP12P39900 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP12P39900 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP12P39900 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP12P39900 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP12P39900 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP12P39900 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP12P39900 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP12P39900 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP12P39900 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP12P39900 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP12P39900 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP12P39900 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP12P39900 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP12P39900 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP12P39900 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP12P39900 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP12P39900 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP12P39900 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP12P39900 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP12P39900 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP12P39900 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP12P39900 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP12P39900 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP12P39900 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP12P39900 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP12P39900 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP12P39900 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP12P39900 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP12P39900 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP12P39900 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP12P39900 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP12P39900 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP12P39900 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP12P39900 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP12P39900 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP12P39900 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP12P39900 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP12P39900 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP12P39900 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP12P39900 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP12P39900 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP12P39900 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP12P39900 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP12P39900 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP12P39900 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP12P39900 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP12P39900 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP12P39900 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP12P39900 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP12P39900 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP12P39900 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP12P39900 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP12P39900 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP12P39900 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP12P39900 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP12P39900 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP12P39900 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP12P39900 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP12P39900 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP12P39900 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP12P39900 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP12P39900 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP12P39900 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP12P39900 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP12P39900 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP12P39900 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP12P39900 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP12P39900 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP12P39900 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP12P39900 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP12P39900 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP12P39900 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP12P39900 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP12P39900 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP12P39900 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP12P39900 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP12P39900 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP12P39900 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP12P39900 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP12P39900 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP12P39900 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP12P39900 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP12P39900 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP12P39900 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP12P39900 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP12P39900 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP12P39900 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP12P39900 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP12P39900 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms