Protein–RNA interactions for Protein: P38996

NAB3, Nuclear polyadenylated RNA-binding protein 3, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 802 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NAB3	P38996	RPO21	YDL140C	5202 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	TCO89	YPL180W	2400 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	RRN11	YML043C	1524 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	OSH2	YDL019C	3852 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	SKG3	YLR187W	3081 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	COX26	YDR119W-A	201 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	ATP5	YDR298C	639 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	HSX1	tR(CCU)J	72 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	VMA16	YHR026W	642 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	CPR6	YLR216C	1116 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	SSP120	YLR250W	705 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	TOM7	YNL070W	183 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	ARR3	YPR201W	1215 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	PRS5	YOL061W	1491 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	JHD2	YJR119C	2187 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	PTC1	YDL006W	846 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	RPC11	YDR045C	333 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	YGR149W	YGR149W	1299 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	YLL059C	YLL059C	507 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	UBC4	YBR082C	447 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	MRPL36	YBR122C	534 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	OPY1	YBR129C	987 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	GEP3	YOR205C	1671 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	APL4	YPR029C	2499 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	YSH1	YLR277C	2340 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	RPS11A	YDR025W	471 nt		4.9	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	YBL044W	YBL044W	369 nt		4.9	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	YNL144W-A	YNL144W-A	84 nt		4.9	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	TAF14	YPL129W	735 nt		4.9	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	STE7	YDL159W	1548 nt		4.9	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	CTK1	YKL139W	1587 nt		4.9	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	DED81	YHR019C	1665 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	ULS1	YOR191W	4860 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	PEP7	YDR323C	1548 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	YCR007C	YCR007C	720 nt		4.89	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
NAB3	P38996	YCR097W-A	YCR097W-A	267 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	YDR161W	YDR161W	1164 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	tN(GUU)C	tN(GUU)C	74 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	tN(GUU)F	tN(GUU)F	74 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	tN(GUU)G	tN(GUU)G	74 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	tN(GUU)K	tN(GUU)K	74 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	tN(GUU)L	tN(GUU)L	74 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	tN(GUU)N1	tN(GUU)N1	74 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	tN(GUU)N2	tN(GUU)N2	74 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	tN(GUU)O1	tN(GUU)O1	74 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	tN(GUU)O2	tN(GUU)O2	74 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	tN(GUU)P	tN(GUU)P	74 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	CIR1	YGR207C	786 nt		4.89	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
NAB3	P38996	MNN11	YJL183W	1269 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	MTW1	YAL034W-A	870 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	TFS1	YLR178C	660 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	RAD10	YML095C	633 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	ARC40	YBR234C	1155 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	MSA1	YOR066W	1890 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	KRE6	YPR159W	2163 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	YMR102C	YMR102C	2505 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	HOS3	YPL116W	2094 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	UBP12	YJL197W	3765 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	YOL075C	YOL075C	3885 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	YDL034W	YDL034W	345 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	GIR2	YDR152W	798 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	SYF2	YGR129W	648 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	REE1	YJL217W	597 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	MRP17	YKL003C	396 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	SRP40	YKR092C	1221 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	ARG80	YMR042W	534 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	COG5	YNL051W	1212 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	HRT1	YOL133W	366 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	VPS69	YPR087W	321 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	ULA1	YPL003W	1389 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	SEN1	YLR430W	6696 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	RSC6	YCR052W	1452 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	SED4	YCR067C	3198 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	snR63	snR63	255 nt		4.87	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	HAT2	YEL056W	1206 nt		4.87	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	MTR2	YKL186C	555 nt		4.87	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	MCM16	YPR046W	546 nt		4.87	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	HFI1	YPL254W	1467 nt		4.87	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	RTS1	YOR014W	2274 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	AAD4	YDL243C	990 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	FMP10	YER182W	735 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	MIC26	YGR235C	702 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	RAD27	YKL113C	1149 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	HRT3	YLR097C	1035 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	BBP1	YPL255W	1158 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	YBR230W-A	YBR230W-A	201 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	MRPL37	YBR268W	318 nt		4.86	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
NAB3	P38996	SKG6	YHR149C	2205 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	MGA1	YGR249W	1371 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	MGR3	YMR115W	1506 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	YHR045W	YHR045W	1683 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	AGA1	YNR044W	2178 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	SCW4	YGR279C	1161 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	DCN1	YLR128W	810 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	CTR3	YLR411W	726 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	DAL82	YNL314W	768 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	YBL094C	YBL094C	333 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	VPS68	YOL129W	555 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	TAF6	YGL112C	1551 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NAB3	P38996	RAD30	YDR419W	1899 nt		4.85	□□□□□ -1.63

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