Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH11P35749 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH11P35749 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH11P35749 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH11P35749 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH11P35749 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH11P35749 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH11P35749 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH11P35749 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH11P35749 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH11P35749 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH11P35749 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH11P35749 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH11P35749 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH11P35749 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYH11P35749 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYH11P35749 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYH11P35749 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYH11P35749 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MYH11P35749 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYH11P35749 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYH11P35749 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYH11P35749 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYH11P35749 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYH11P35749 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYH11P35749 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYH11P35749 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYH11P35749 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYH11P35749 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYH11P35749 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYH11P35749 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYH11P35749 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MYH11P35749 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYH11P35749 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYH11P35749 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYH11P35749 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYH11P35749 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MYH11P35749 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYH11P35749 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYH11P35749 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYH11P35749 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYH11P35749 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYH11P35749 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYH11P35749 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYH11P35749 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYH11P35749 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYH11P35749 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYH11P35749 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYH11P35749 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYH11P35749 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYH11P35749 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYH11P35749 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYH11P35749 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYH11P35749 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYH11P35749 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MYH11P35749 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYH11P35749 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MYH11P35749 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYH11P35749 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MYH11P35749 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYH11P35749 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYH11P35749 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MYH11P35749 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYH11P35749 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYH11P35749 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYH11P35749 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYH11P35749 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYH11P35749 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYH11P35749 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYH11P35749 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYH11P35749 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYH11P35749 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYH11P35749 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYH11P35749 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYH11P35749 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYH11P35749 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYH11P35749 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYH11P35749 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYH11P35749 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYH11P35749 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYH11P35749 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYH11P35749 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYH11P35749 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYH11P35749 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYH11P35749 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYH11P35749 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MYH11P35749 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MYH11P35749 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MYH11P35749 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MYH11P35749 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYH11P35749 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYH11P35749 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYH11P35749 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYH11P35749 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYH11P35749 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYH11P35749 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYH11P35749 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYH11P35749 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYH11P35749 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYH11P35749 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms