Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTN2P35609 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms