Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN7P35236 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms