Protein–RNA interactions for Protein: P32842

VMA11, V-type proton ATPase subunit c', yeast

Predictions only

Length 164 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA11	P32842	tK(CUU)D1	tK(CUU)D1	73 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	tK(CUU)D2	tK(CUU)D2	73 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	tK(CUU)E1	tK(CUU)E1	73 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	tK(CUU)E2	tK(CUU)E2	73 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	tK(CUU)F	tK(CUU)F	73 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	tK(CUU)G1	tK(CUU)G1	73 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	tK(CUU)G2	tK(CUU)G2	73 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	tK(CUU)G3	tK(CUU)G3	73 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	tK(CUU)I	tK(CUU)I	73 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	tK(CUU)J	tK(CUU)J	73 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	tK(CUU)K	tK(CUU)K	73 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	tK(CUU)M	tK(CUU)M	73 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	tK(CUU)P	tK(CUU)P	73 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	YIL163C	YIL163C	354 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	EFB1	YAL003W	621 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	UIP3	YAR027W	708 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	YBR141W-A	YBR141W-A	96 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	IMA3	YIL172C	1770 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	IMA4	YJL221C	1770 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	PMT4	YJR143C	2289 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	TRM11	YOL124C	1302 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	UPC2	YDR213W	2742 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	BRE4	YDL231C	3378 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	THI22	YPR121W	1719 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	TYW1	YPL207W	2433 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	CDC6	YJL194W	1542 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	PER1	YCR044C	1074 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	BUD16	YEL029C	939 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	YIL171W	YIL171W	330 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	YJR038C	YJR038C	363 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	CDC42	YLR229C	576 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	YPR059C	YPR059C	387 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	ARC40	YBR234C	1155 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	RAD52	YML032C	1416 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	DXO1	YDR370C	1329 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	MET17	YLR303W	1335 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	HCM1	YCR065W	1695 nt		3.4	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	PAH1	YMR165C	2589 nt		3.4	□□□□□ -1.86
VMA11	P32842	PTC1	YDL006W	846 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	RPS13	YDR064W	456 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	MRPL7	YDR237W	879 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	YEL028W	YEL028W	462 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	SPC105	YGL093W	2754 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	SPT23	YKL020C	3249 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	YLR124W	YLR124W	345 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	YLR374C	YLR374C	390 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	DSS4	YPR017C	432 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	HMG1	YML075C	3165 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	PRD1	YCL057W	2139 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	RSC58	YLR033W	1509 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	KRE29	YER038C	1395 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	ECM22	YLR228C	2445 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	BUD13	YGL174W	801 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	CDC12	YHR107C	1224 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	GVP36	YIL041W	981 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	ELO3	YLR372W	1038 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	CWC25	YNL245C	540 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	YOL079W	YOL079W	399 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	YPR174C	YPR174C	666 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	ARR1	YPR199C	885 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	SAS10	YDL153C	1833 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	ATG32	YIL146C	1590 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	OAF1	YAL051W	3144 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	IMG2	YCR071C	441 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	YGL262W	YGL262W	528 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	RDN5-1	RDN5-1	121 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	RDN5-6	RDN5-6	121 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	YMR130W	YMR130W	909 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	YOR034C-A	YOR034C-A	243 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	RET3	YPL010W	570 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	VPS69	YPR087W	321 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	RSC3	YDR303C	2658 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	HST1	YOL068C	1512 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	NUP2	YLR335W	2163 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	MCM2	YBL023C	2607 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	NTA1	YJR062C	1374 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	SET4	YJL105W	1683 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	OPT2	YPR194C	2634 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	PUT2	YHR037W	1728 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	IRC22	YEL001C	678 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	YGL152C	YGL152C	678 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	tQ(UUG)C	tQ(UUG)C	72 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	tQ(UUG)D1	tQ(UUG)D1	72 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	tQ(UUG)D2	tQ(UUG)D2	72 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	tQ(UUG)D3	tQ(UUG)D3	72 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	tQ(UUG)E1	tQ(UUG)E1	72 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	tQ(UUG)H	tQ(UUG)H	72 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	tQ(UUG)L	tQ(UUG)L	72 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	AAD10	YJR155W	867 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	ADD66	YKL206C	804 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	PRM9	YAR031W	897 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	YBR219C	YBR219C	384 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	LAS1	YKR063C	1509 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	GIP4	YAL031C	2283 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	POL12	YBL035C	2118 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	CDC14	YFR028C	1656 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	BDP1	YNL039W	1785 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	SAT4	YCR008W	1812 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	XKS1	YGR194C	1803 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VMA11	P32842	DAS2	YDR020C	699 nt		3.36	□□□□□ -1.87

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