Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCKBRP32239 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCKBRP32239 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCKBRP32239 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCKBRP32239 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCKBRP32239 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCKBRP32239 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCKBRP32239 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCKBRP32239 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCKBRP32239 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCKBRP32239 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCKBRP32239 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCKBRP32239 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCKBRP32239 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCKBRP32239 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCKBRP32239 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCKBRP32239 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCKBRP32239 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms