Protein–RNA interactions for Protein: P31930

UQCRC1, Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRC1P31930 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
UQCRC1P31930 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UQCRC1P31930 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms