Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA7P31268 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA7P31268 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms