Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTKP29376 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTKP29376 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTKP29376 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTKP29376 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTKP29376 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
LTKP29376 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTKP29376 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTKP29376 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTKP29376 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTKP29376 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTKP29376 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LTKP29376 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LTKP29376 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LTKP29376 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LTKP29376 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LTKP29376 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LTKP29376 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LTKP29376 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LTKP29376 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LTKP29376 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
LTKP29376 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
LTKP29376 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LTKP29376 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LTKP29376 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LTKP29376 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
LTKP29376 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
LTKP29376 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LTKP29376 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LTKP29376 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
LTKP29376 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
LTKP29376 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
LTKP29376 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LTKP29376 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LTKP29376 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LTKP29376 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LTKP29376 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
LTKP29376 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
LTKP29376 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LTKP29376 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LTKP29376 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LTKP29376 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LTKP29376 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LTKP29376 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LTKP29376 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LTKP29376 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LTKP29376 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LTKP29376 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LTKP29376 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTKP29376 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTKP29376 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTKP29376 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTKP29376 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTKP29376 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTKP29376 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTKP29376 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
LTKP29376 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTKP29376 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
LTKP29376 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTKP29376 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTKP29376 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTKP29376 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
LTKP29376 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LTKP29376 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LTKP29376 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LTKP29376 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LTKP29376 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
LTKP29376 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LTKP29376 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LTKP29376 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LTKP29376 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LTKP29376 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LTKP29376 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LTKP29376 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LTKP29376 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LTKP29376 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LTKP29376 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LTKP29376 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LTKP29376 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
LTKP29376 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
LTKP29376 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LTKP29376 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LTKP29376 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LTKP29376 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
LTKP29376 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
LTKP29376 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
LTKP29376 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
LTKP29376 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LTKP29376 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LTKP29376 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LTKP29376 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LTKP29376 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LTKP29376 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
LTKP29376 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LTKP29376 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LTKP29376 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LTKP29376 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LTKP29376 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LTKP29376 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LTKP29376 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms