Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE4AP27815 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE4AP27815 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4AP27815 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms