Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPA1P27694 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPA1P27694 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPA1P27694 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPA1P27694 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPA1P27694 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPA1P27694 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPA1P27694 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPA1P27694 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPA1P27694 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPA1P27694 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPA1P27694 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPA1P27694 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPA1P27694 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPA1P27694 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPA1P27694 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPA1P27694 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPA1P27694 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPA1P27694 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPA1P27694 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPA1P27694 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RPA1P27694 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPA1P27694 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPA1P27694 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RPA1P27694 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPA1P27694 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA1P27694 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPA1P27694 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPA1P27694 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPA1P27694 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPA1P27694 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPA1P27694 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPA1P27694 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPA1P27694 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RPA1P27694 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPA1P27694 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPA1P27694 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPA1P27694 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPA1P27694 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPA1P27694 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPA1P27694 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPA1P27694 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPA1P27694 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPA1P27694 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPA1P27694 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPA1P27694 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPA1P27694 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RPA1P27694 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPA1P27694 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPA1P27694 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPA1P27694 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPA1P27694 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA1P27694 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA1P27694 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA1P27694 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA1P27694 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA1P27694 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA1P27694 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA1P27694 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA1P27694 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA1P27694 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA1P27694 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA1P27694 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA1P27694 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms