Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARK3P27448 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARK3P27448 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARK3P27448 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARK3P27448 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MARK3P27448 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARK3P27448 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARK3P27448 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARK3P27448 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARK3P27448 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARK3P27448 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARK3P27448 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARK3P27448 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARK3P27448 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARK3P27448 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARK3P27448 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARK3P27448 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARK3P27448 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARK3P27448 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARK3P27448 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARK3P27448 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARK3P27448 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARK3P27448 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARK3P27448 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARK3P27448 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARK3P27448 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARK3P27448 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARK3P27448 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARK3P27448 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MARK3P27448 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARK3P27448 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARK3P27448 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARK3P27448 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARK3P27448 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MARK3P27448 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARK3P27448 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARK3P27448 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARK3P27448 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARK3P27448 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARK3P27448 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARK3P27448 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARK3P27448 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARK3P27448 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARK3P27448 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK3P27448 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK3P27448 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK3P27448 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK3P27448 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK3P27448 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK3P27448 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK3P27448 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK3P27448 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK3P27448 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK3P27448 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK3P27448 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK3P27448 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK3P27448 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK3P27448 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK3P27448 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK3P27448 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK3P27448 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK3P27448 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK3P27448 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK3P27448 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK3P27448 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARK3P27448 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARK3P27448 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARK3P27448 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARK3P27448 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARK3P27448 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARK3P27448 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARK3P27448 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARK3P27448 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARK3P27448 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARK3P27448 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARK3P27448 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARK3P27448 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARK3P27448 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARK3P27448 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARK3P27448 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARK3P27448 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARK3P27448 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARK3P27448 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARK3P27448 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARK3P27448 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARK3P27448 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARK3P27448 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARK3P27448 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARK3P27448 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARK3P27448 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARK3P27448 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARK3P27448 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARK3P27448 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARK3P27448 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARK3P27448 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARK3P27448 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MARK3P27448 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARK3P27448 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARK3P27448 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARK3P27448 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms