Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRYBB3P26998 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRYBB3P26998 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CRYBB3P26998 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBB3P26998 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBB3P26998 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBB3P26998 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBB3P26998 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBB3P26998 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBB3P26998 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBB3P26998 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBB3P26998 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBB3P26998 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBB3P26998 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBB3P26998 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms