Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTSSP25774 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTSSP25774 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTSSP25774 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTSSP25774 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTSSP25774 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTSSP25774 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTSSP25774 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTSSP25774 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTSSP25774 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTSSP25774 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTSSP25774 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTSSP25774 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTSSP25774 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTSSP25774 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTSSP25774 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTSSP25774 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTSSP25774 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTSSP25774 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTSSP25774 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTSSP25774 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTSSP25774 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTSSP25774 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTSSP25774 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTSSP25774 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTSSP25774 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTSSP25774 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTSSP25774 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTSSP25774 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTSSP25774 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTSSP25774 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTSSP25774 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CTSSP25774 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTSSP25774 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTSSP25774 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTSSP25774 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTSSP25774 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTSSP25774 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTSSP25774 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CTSSP25774 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTSSP25774 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CTSSP25774 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTSSP25774 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTSSP25774 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTSSP25774 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTSSP25774 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTSSP25774 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTSSP25774 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTSSP25774 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTSSP25774 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTSSP25774 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTSSP25774 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTSSP25774 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTSSP25774 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTSSP25774 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTSSP25774 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTSSP25774 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTSSP25774 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTSSP25774 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTSSP25774 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTSSP25774 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTSSP25774 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTSSP25774 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTSSP25774 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTSSP25774 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTSSP25774 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTSSP25774 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTSSP25774 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTSSP25774 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CTSSP25774 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTSSP25774 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTSSP25774 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTSSP25774 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTSSP25774 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTSSP25774 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTSSP25774 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTSSP25774 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CTSSP25774 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTSSP25774 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms