Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAX3P23760 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PAX3P23760 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAX3P23760 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAX3P23760 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAX3P23760 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAX3P23760 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAX3P23760 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAX3P23760 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAX3P23760 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAX3P23760 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PAX3P23760 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAX3P23760 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAX3P23760 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAX3P23760 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAX3P23760 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAX3P23760 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAX3P23760 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAX3P23760 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAX3P23760 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAX3P23760 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAX3P23760 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAX3P23760 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAX3P23760 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAX3P23760 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAX3P23760 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAX3P23760 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAX3P23760 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PAX3P23760 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAX3P23760 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAX3P23760 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX3P23760 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX3P23760 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX3P23760 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX3P23760 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX3P23760 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX3P23760 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX3P23760 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX3P23760 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX3P23760 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX3P23760 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX3P23760 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX3P23760 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX3P23760 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX3P23760 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX3P23760 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX3P23760 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX3P23760 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX3P23760 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX3P23760 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX3P23760 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PAX3P23760 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAX3P23760 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAX3P23760 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAX3P23760 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAX3P23760 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAX3P23760 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAX3P23760 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAX3P23760 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAX3P23760 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAX3P23760 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAX3P23760 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PAX3P23760 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAX3P23760 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PAX3P23760 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAX3P23760 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAX3P23760 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAX3P23760 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAX3P23760 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAX3P23760 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAX3P23760 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAX3P23760 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAX3P23760 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAX3P23760 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX3P23760 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX3P23760 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX3P23760 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX3P23760 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX3P23760 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX3P23760 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX3P23760 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX3P23760 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX3P23760 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX3P23760 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX3P23760 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX3P23760 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX3P23760 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX3P23760 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX3P23760 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX3P23760 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX3P23760 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX3P23760 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX3P23760 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX3P23760 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAX3P23760 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAX3P23760 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAX3P23760 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAX3P23760 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAX3P23760 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAX3P23760 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms