Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHCGRP22888 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms