Protein–RNA interactions for Protein: P22314

UBA1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA1P22314 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA1P22314 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA1P22314 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA1P22314 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA1P22314 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA1P22314 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA1P22314 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA1P22314 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA1P22314 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA1P22314 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA1P22314 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA1P22314 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBA1P22314 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBA1P22314 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBA1P22314 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBA1P22314 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBA1P22314 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBA1P22314 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBA1P22314 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBA1P22314 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA1P22314 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA1P22314 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA1P22314 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA1P22314 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA1P22314 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA1P22314 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA1P22314 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA1P22314 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA1P22314 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA1P22314 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA1P22314 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA1P22314 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA1P22314 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA1P22314 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA1P22314 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA1P22314 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA1P22314 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA1P22314 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA1P22314 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA1P22314 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA1P22314 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA1P22314 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA1P22314 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA1P22314 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA1P22314 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA1P22314 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA1P22314 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBA1P22314 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBA1P22314 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBA1P22314 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA1P22314 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA1P22314 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA1P22314 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA1P22314 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA1P22314 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA1P22314 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA1P22314 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA1P22314 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA1P22314 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA1P22314 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA1P22314 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA1P22314 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA1P22314 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA1P22314 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA1P22314 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA1P22314 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA1P22314 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA1P22314 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA1P22314 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA1P22314 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA1P22314 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA1P22314 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA1P22314 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA1P22314 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA1P22314 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA1P22314 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBA1P22314 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBA1P22314 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBA1P22314 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBA1P22314 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBA1P22314 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBA1P22314 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms