Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCLP19338 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCLP19338 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCLP19338 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCLP19338 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCLP19338 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCLP19338 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCLP19338 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCLP19338 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCLP19338 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCLP19338 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCLP19338 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCLP19338 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCLP19338 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCLP19338 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCLP19338 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCLP19338 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCLP19338 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCLP19338 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCLP19338 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCLP19338 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCLP19338 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCLP19338 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCLP19338 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCLP19338 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCLP19338 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCLP19338 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCLP19338 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCLP19338 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCLP19338 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCLP19338 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NCLP19338 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCLP19338 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCLP19338 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCLP19338 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCLP19338 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NCLP19338 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCLP19338 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCLP19338 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCLP19338 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCLP19338 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NCLP19338 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCLP19338 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCLP19338 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCLP19338 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCLP19338 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCLP19338 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCLP19338 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCLP19338 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCLP19338 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCLP19338 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCLP19338 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NCLP19338 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCLP19338 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCLP19338 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCLP19338 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCLP19338 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCLP19338 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCLP19338 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCLP19338 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCLP19338 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCLP19338 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCLP19338 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NCLP19338 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCLP19338 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCLP19338 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCLP19338 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCLP19338 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCLP19338 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCLP19338 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCLP19338 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCLP19338 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCLP19338 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCLP19338 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCLP19338 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCLP19338 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCLP19338 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCLP19338 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCLP19338 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCLP19338 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCLP19338 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms