Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI1P19237 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms