Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms