Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB9P17482 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms