Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZSCAN20P17040 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSCAN20P17040 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms