Protein–RNA interactions for Protein: P16473

TSHR, Thyrotropin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHRP16473 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSHRP16473 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSHRP16473 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSHRP16473 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSHRP16473 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSHRP16473 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSHRP16473 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSHRP16473 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSHRP16473 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSHRP16473 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSHRP16473 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSHRP16473 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSHRP16473 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSHRP16473 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSHRP16473 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSHRP16473 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSHRP16473 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSHRP16473 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSHRP16473 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSHRP16473 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSHRP16473 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSHRP16473 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSHRP16473 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSHRP16473 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSHRP16473 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSHRP16473 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSHRP16473 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSHRP16473 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSHRP16473 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSHRP16473 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSHRP16473 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSHRP16473 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSHRP16473 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSHRP16473 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSHRP16473 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSHRP16473 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSHRP16473 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSHRP16473 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSHRP16473 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSHRP16473 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSHRP16473 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSHRP16473 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSHRP16473 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSHRP16473 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSHRP16473 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSHRP16473 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSHRP16473 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSHRP16473 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSHRP16473 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSHRP16473 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSHRP16473 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSHRP16473 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSHRP16473 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSHRP16473 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSHRP16473 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSHRP16473 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSHRP16473 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSHRP16473 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSHRP16473 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSHRP16473 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSHRP16473 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSHRP16473 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSHRP16473 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSHRP16473 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSHRP16473 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSHRP16473 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSHRP16473 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSHRP16473 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSHRP16473 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSHRP16473 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSHRP16473 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSHRP16473 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSHRP16473 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSHRP16473 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSHRP16473 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSHRP16473 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSHRP16473 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSHRP16473 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSHRP16473 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSHRP16473 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSHRP16473 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSHRP16473 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSHRP16473 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSHRP16473 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSHRP16473 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSHRP16473 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSHRP16473 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSHRP16473 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSHRP16473 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSHRP16473 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSHRP16473 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSHRP16473 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSHRP16473 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSHRP16473 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSHRP16473 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSHRP16473 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSHRP16473 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSHRP16473 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSHRP16473 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSHRP16473 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms