Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPB42P16452 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPB42P16452 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPB42P16452 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPB42P16452 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPB42P16452 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPB42P16452 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPB42P16452 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPB42P16452 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPB42P16452 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPB42P16452 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPB42P16452 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPB42P16452 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPB42P16452 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPB42P16452 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPB42P16452 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPB42P16452 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPB42P16452 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPB42P16452 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPB42P16452 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPB42P16452 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPB42P16452 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPB42P16452 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPB42P16452 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPB42P16452 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPB42P16452 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPB42P16452 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPB42P16452 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPB42P16452 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPB42P16452 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPB42P16452 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPB42P16452 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPB42P16452 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPB42P16452 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPB42P16452 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPB42P16452 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EPB42P16452 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
EPB42P16452 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPB42P16452 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EPB42P16452 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPB42P16452 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPB42P16452 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPB42P16452 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPB42P16452 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EPB42P16452 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPB42P16452 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPB42P16452 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPB42P16452 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPB42P16452 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPB42P16452 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPB42P16452 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EPB42P16452 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPB42P16452 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPB42P16452 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPB42P16452 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPB42P16452 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPB42P16452 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EPB42P16452 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EPB42P16452 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPB42P16452 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPB42P16452 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPB42P16452 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPB42P16452 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPB42P16452 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPB42P16452 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPB42P16452 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPB42P16452 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPB42P16452 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPB42P16452 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPB42P16452 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPB42P16452 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EPB42P16452 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPB42P16452 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPB42P16452 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPB42P16452 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPB42P16452 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPB42P16452 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPB42P16452 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms